RHEL,CentOSで「is a duplicate」と表示されてyum update出来なくなった際の対処方法と注意点
yumでupdateしている途中にSSHのセッションが切れたり、Kernel Panicになると、以後yum updateしようとした際に以下のように「is a duplicate」と表示されてアップデートできなくなってしまう場合があります。
avahi-glib-0.6.25-12.el6_5.3.x86_64 is a duplicate with avahi-glib-0.6.25-12.el6 avahi-libs-0.6.25-12.el6_5.3.x86_64 is a duplicate with avahi-libs-0.6.25-12.el6 coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 is a duplicate with coreutils-8.4-31.el6_5.1.x86 coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 is a duplicate with coreutils-libs-8.4-31.e glibc-2.12-1.132.el6_5.4.x86_64 is a duplicate with glibc-2.12-1.132.el6_5.2.x86 glibc-common-2.12-1.132.el6_5.4.x86_64 is a duplicate with glibc-common-2.12-1.1 kernel-firmware-2.6.32-431.29.2.el6.noarch is a duplicate with kernel-firmware-2 libcom_err-1.41.12-18.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with libcom_err-1.41.12-18.e libss-1.41.12-18.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with libss-1.41.12-18.el6.x86_64 libtirpc-0.2.1-6.el6_5.2.x86_64 is a duplicate with libtirpc-0.2.1-6.el6_5.1.x86 libvirt-client-0.10.2-29.el6_5.12.x86_64 is a duplicate with libvirt-client-0.10 libvpx-1.3.0-5.el6_5.x86_64 is a duplicate with libvpx-0.9.0-8.el6_0.x86_64 libxml2-2.7.6-14.el6_5.2.x86_64 is a duplicate with libxml2-2.7.6-14.el6_5.1.x86 libxml2-python-2.7.6-14.el6_5.2.x86_64 is a duplicate with libxml2-python-2.7.6- nfs-utils-lib-1.1.5-6.el6_5.x86_64 is a duplicate with nfs-utils-lib-1.1.5-6.el6 nspr-4.10.6-1.el6_5.x86_64 is a duplicate with nspr-4.10.2-1.el6_5.x86_64 nss-util-3.16.1-1.el6_5.x86_64 is a duplicate with nss-util-3.15.3-1.el6_5.x86_6 plymouth-core-libs-0.8.3-27.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with plymouth-core-lib plymouth-graphics-libs-0.8.3-27.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with plymouth-grap plymouth-plugin-label-0.8.3-27.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with plymouth-plugi plymouth-plugin-two-step-0.8.3-27.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with plymouth-pl plymouth-scripts-0.8.3-27.el6_5.1.x86_64 is a duplicate with plymouth-scripts-0. 2:qemu-img-0.12.1.2-2.415.el6_5.14.x86_64 is a duplicate with 2:qemu-img-0.12.1. tzdata-2014g-1.el6.noarch is a duplicate with tzdata-2014d-1.el6.noarch
対処方法としては、
avahi-glib-0.6.25-12.el6_5.3.x86_64 is a duplicate with avahi-glib-0.6.25-12.el6
の場合は、
rpm -e avahi-glib-0.6.25-12.el6_5.3.x86_64
で左側に表示されている方をアンインストールします。複数ある場合は、１つずつ行っていきます。
glibcのようにglibcとglibc-commonで互いに依存し合っている場合は、
rpm -e glibc-2.12-1.132.el6_5.4.x86_64 glibc-common-2.12-1.132.el6_5.4.x86_64
とします。
該当するパッケージを全てアンインストールできたら、yum updateしてアップデートが行えるようになります。
なお、以下のサイトを含めていくつかのサイトで紹介されている
yum-complete-transaction yum check duplicates | awk '/is a duplicate/ {print $6}' > /tmp/DUPES yum remove `cat /tmp/DUPES`
という手順は、該当するパッケージだけでなくそのパッケージに依存している他のパッケージも削除されてしまう場合がありますので注意が必要です。削除されたパッケージによっては、最悪OSが立ち上がらなくなる、正常に動作しなくなる等の可能性があります。（この手順自体かなりリスキーです）
yum, rpm and duplicate versions | Ogre.com
[yum] is a duplicate with のエラーで進まなくなったらの巻
virtualmin からのパッケージアップデートでこけるのでなんとかした | wp.takashick.tk
いつか、そのとき、あの場所で。 | [メモ][RHEL] yum updateがうまく動かなくなったので復旧を試みてみた。
どれくらい注意が必要かと言いますと、
yum check duplicates | awk '/is a duplicate/ {print $6}' > /tmp/DUPES
で出力された/tmp/DUPESの内容が以下の通りだったとします。
avahi-glib-0.6.25-12.el6.x86_64 avahi-libs-0.6.25-12.el6.x86_64 coreutils-8.4-31.el6_5.1.x86_64 coreutils-libs-8.4-31.el6_5.1.x86_64 e2fsprogs-libs-1.41.12-18.el6.x86_64 glibc-2.12-1.132.el6_5.2.x86_64 glibc-common-2.12-1.132.el6_5.2.x86_64 kernel-firmware-2.6.32-431.17.1.el6.noarch libcom_err-1.41.12-18.el6.x86_64 libss-1.41.12-18.el6.x86_64 libtirpc-0.2.1-6.el6_5.1.x86_64 libvirt-client-0.10.2-29.el6_5.8.x86_64 libvpx-0.9.0-8.el6_0.x86_64 libxml2-2.7.6-14.el6_5.1.x86_64 libxml2-python-2.7.6-14.el6_5.1.x86_64 nfs-utils-lib-1.1.5-6.el6.x86_64 nspr-4.10.2-1.el6_5.x86_64 nss-util-3.15.3-1.el6_5.x86_64 plymouth-core-libs-0.8.3-27.el6.x86_64 plymouth-graphics-libs-0.8.3-27.el6.x86_64 plymouth-plugin-label-0.8.3-27.el6.x86_64 plymouth-plugin-two-step-0.8.3-27.el6.x86_64 plymouth-scripts-0.8.3-27.el6.x86_64 2:qemu-img-0.12.1.2-2.415.el6_5.8.x86_64 tzdata-2014d-1.el6.noarch
それらを
yum remove `cat /tmp/DUPES`
すると、以下のような結果になります。
なんということでしょう！「/tmp/DUPES」で指定されたパッケージのみ削除したいのに、「Removing for dependencies」に記載されているパッケージまで削除しようとしています。
分かる人には分かると思いますが、このまま「y」で進んでしまうと、そのあと最悪の状況になるかも知れないということは理解いただけると思います。
Dependencies Resolved ================================================================================ Package Arch Version Repository ================================================================================ Removing: avahi-glib x86_64 0.6.25-12.el6 @rhel-x86_64-server-6 avahi-libs x86_64 0.6.25-12.el6 @rhel-x86_64-server-6 coreutils x86_64 8.4-31.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms coreutils-libs x86_64 8.4-31.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms e2fsprogs-libs x86_64 1.41.12-18.el6 @rhel-6-server-rpms glibc x86_64 2.12-1.132.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms glibc-common x86_64 2.12-1.132.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms libcom_err x86_64 1.41.12-18.el6 @rhel-6-server-rpms libss x86_64 1.41.12-18.el6 @rhel-6-server-rpms libtirpc x86_64 0.2.1-6.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms libvirt-client x86_64 0.10.2-29.el6_5.8 @rhel-6-server-rpms libvpx x86_64 0.9.0-8.el6_0 @anaconda-RedHatEnter libxml2 x86_64 2.7.6-14.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms libxml2-python x86_64 2.7.6-14.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms nfs-utils-lib x86_64 1.1.5-6.el6 @rhel-6-server-rpms nspr x86_64 4.10.2-1.el6_5 @rhel-6-server-rpms nss-util x86_64 3.15.3-1.el6_5 @rhel-6-server-rpms plymouth-core-libs x86_64 0.8.3-27.el6 @rhel-x86_64-server-6 plymouth-graphics-libs x86_64 0.8.3-27.el6 @rhel-x86_64-server-6 plymouth-plugin-label x86_64 0.8.3-27.el6 @rhel-x86_64-server-6 plymouth-plugin-two-step x86_64 0.8.3-27.el6 @rhel-x86_64-server-6 plymouth-scripts x86_64 0.8.3-27.el6 @rhel-x86_64-server-6 qemu-img x86_64 2:0.12.1.2-2.415.el6_5.8 @rhel-6-server-rpms tzdata noarch 2014d-1.el6 @rhel-6-server-rpms Removing for dependencies: avahi x86_64 0.6.25-12.el6 @rhel-x86_64-server-6 bluez x86_64 4.66-1.el6 @anaconda-RedHatEnter brasero-nautilus x86_64 2.28.3-6.el6 @anaconda-RedHatEnter compat-libstdc++-296 i686 2.96-144.el6 @rhel-x86_64-server-6 cpqacuxe i386 8.70-9.0 installed dracut noarch 004-336.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms dracut-kernel noarch 004-336.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms e2fsprogs x86_64 1.41.12-18.el6 @rhel-6-server-rpms expat i686 2.0.1-11.el6_2 @rhel-x86_64-server-6 f-secure-automatic-update-agent i386 8.26.6095-1 installed f-secure-linux-security i686 9.12.1818-1 installed f-secure-management-agent-unix i386 4.77.52-1 installed f-secure-perl-pgsql-interface i386 7.00-1 installed f-secure-postgresql i386 8.1.9-13 installed febootstrap-supermin-helper x86_64 3.21-4.el6 @rhel-6-server-rpms file-roller x86_64 2.28.2-6.el6 @anaconda-RedHatEnter fontconfig i686 2.8.0-3.el6 @rhel-x86_64-server-6 freetype i686 2.3.11-14.el6_3.1 @rhel-x86_64-server-6 gcc x86_64 4.4.7-4.el6 @rhel-6-server-rpms gcc-c++ x86_64 4.4.7-4.el6 @rhel-6-server-rpms gcc-gfortran x86_64 4.4.7-4.el6 @rhel-6-server-rpms gdm x86_64 1:2.30.4-52.el6 @rhel-6-server-rpms gdm-plugin-fingerprint x86_64 1:2.30.4-52.el6 @rhel-6-server-rpms gdm-user-switch-applet x86_64 1:2.30.4-52.el6 @rhel-6-server-rpms glibc i686 2.12-1.132.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms glibc-devel x86_64 2.12-1.132.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms glibc-headers x86_64 2.12-1.132.el6_5.2 @rhel-6-server-rpms gnome-bluetooth x86_64 2.28.6-8.el6 @anaconda-RedHatEnter gnome-disk-utility x86_64 2.30.1-2.el6 @anaconda-RedHatEnter gnome-disk-utility-libs x86_64 2.30.1-2.el6 @anaconda-RedHatEnter gnome-disk-utility-ui-libs x86_64 2.30.1-2.el6 @anaconda-RedHatEnter gstreamer-plugins-bad-free x86_64 0.10.19-2.el6 @anaconda-RedHatEnter gvfs x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms gvfs-afc x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms gvfs-archive x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms gvfs-fuse x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms gvfs-gphoto2 x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms gvfs-obexftp x86_64 1.4.3-16.el6_5 @rhel-6-server-rpms hp-health x86_64 8.7.0.22-17 installed hp-smh-templates noarch 8.7.0.10-10 installed hp-snmp-agents x86_64 8.7.0.23-17 installed hpacucli i386 8.70-8.0 installed hpvca i386 6.3.0-8 installed kexec-tools x86_64 2.0.0-273.el6 @rhel-6-server-rpms krb5-devel x86_64 1.10.3-15.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms libICE i686 1.0.6-1.el6 @rhel-x86_64-server-6 libSM i686 1.2.1-2.el6 @rhel-x86_64-server-6 libX11 i686 1.5.0-4.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXau i686 1.0.6-4.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXcursor i686 1.1.13-6.20130524git8f677eaea.el6 @rhel-6-server-rpms libXext i686 1.3.1-2.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXfixes i686 5.0-3.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXi i686 1.6.1-3.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXrandr i686 1.4.0-1.el6 @rhel-x86_64-server-6 libXrender i686 0.9.7-2.el6 @rhel-x86_64-server-6 libcom_err-devel x86_64 1.41.12-18.el6 @rhel-6-server-rpms libguestfs x86_64 1:1.20.11-2.el6 @rhel-6-server-rpms libstdc++ i686 4.4.7-4.el6 @rhel-6-server-rpms libtool x86_64 2.2.6-15.5.el6 @rhel-x86_64-server-6 libuuid i686 2.17.2-12.14.el6_5 @rhel-6-server-rpms libvirt x86_64 0.10.2-29.el6_5.8 @rhel-6-server-rpms libvirt-python x86_64 0.10.2-29.el6_5.8 @rhel-6-server-rpms libxcb i686 1.8.1-1.el6 @rhel-x86_64-server-6 libxml2-devel x86_64 2.7.6-14.el6_5.1 @rhel-6-server-rpms nautilus x86_64 2.28.4-19.el6 @rhel-x86_64-server-6 nautilus-extensions x86_64 2.28.4-19.el6 @rhel-x86_64-server-6 nautilus-open-terminal x86_64 0.17-4.el6 @anaconda-RedHatEnter nautilus-sendto x86_64 2.28.2-4.el6 @rhel-6-server-rpms nss-softokn-freebl i686 3.14.3-10.el6_5 @rhel-6-server-rpms openssl-devel x86_64 1.0.1e-16.el6_5.14 @rhel-6-server-rpms pbeagent i386 8.0.1-309 installed perl-Archive-Extract x86_64 1:0.38-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-CPAN x86_64 1.9402-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-CPANPLUS x86_64 0.88-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-ExtUtils-CBuilder x86_64 1:0.27-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-ExtUtils-Embed x86_64 1.28-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-ExtUtils-MakeMaker x86_64 6.55-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-ExtUtils-ParseXS x86_64 1:2.2003.0-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-File-Fetch x86_64 0.26-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-IPC-Cmd x86_64 1:0.56-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-Module-Build x86_64 1:0.3500-136.el6 @rhel-6-server-rpms perl-Test-Harness x86_64 3.17-136.el6 @rhel-6-server-rpms 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systemtap-devel x86_64 2.3-4.el6_5 @rhel-6-server-rpms totem x86_64 2.28.6-4.el6 @rhel-6-server-rpms totem-nautilus x86_64 2.28.6-4.el6 @rhel-6-server-rpms udisks x86_64 1.0.1-7.el6_5 @rhel-6-server-rpms virt-manager x86_64 0.9.0-19.el6 @rhel-6-server-rpms virt-who noarch 0.8-9.el6 @rhel-6-server-rpms zlib i686 1.2.3-29.el6 @rhel-x86_64-server-6 Transaction Summary ================================================================================ Remove 130 Package(s)
